| 序号 | 名 称 | 批准时间 | 批准部门 | 基地类型 |
| 1 | 生态文明建设与流域保护研究院 | 2023 | 江苏省委宣传部 | 江苏省重点培育智库 |
| 2 | 江苏水安全与生态共富研究基地 | 2023 | 江苏省社科联 | 江苏省决策咨询研究基地 |
| 3 | 江苏省流域文化国际传播研究中心 | 2023 | 江苏省人民政府外事办公室 | |
| 4 | 江苏省科技创新智库基地（河海大学） | 2022 | 江苏省科协 | 江苏省科技创新智库基地 |
| 5 | 江苏省习近平新时代中国特色社会主义思想研究中心首批基地理论研究基地（河海大学） | 2022 | 江苏省习近平新时代中国特色社会主义思想研究中心 | |
| 6 | 澜湄国家区域研究中心 | 2021 | 教育部国际合作与交流司 | 教育部备案国别和区域研究中心 |
| 7 | 几内亚湾-科特迪瓦研究中心 | 2021 | 教育部国际合作与交流司 | 教育部备案国别和区域研究中心 |
| 8 | 西非国家经济共同体研究中心 | 2021 | 教育部国际合作与交流司 | 教育部备案国别和区域研究中心 |
| 9 | 新时代基层党建与思想文化建设研究基地 | 2020 | 江苏省教育厅 | 江苏高校哲学社会科学重点研究基地 |
| 10 | 江苏长江保护与高质量发展研究基地 | 2019 | 江苏省社科联 | 江苏省决策咨询重点研究基地 |
| 11 | 环境与社会研究中心 | 2018 | 江苏省教育厅 | 江苏高校哲学社会科学重点建设基地 |
| 12 | 亚洲研究中心 | 2017 | 教育部国际合作与交流司 | 教育部备案国别和区域研究中心 |
| 13 | 水利法治研究中心 | 2017 | 江苏省教育厅 | 江苏高校人文社会科学校外研究基地 |
| 14 | 江苏省中国特色社会主义理论体系研究基地（河海大学） | 2015 | 江苏省委宣传部 | 江苏省中国特色社会主义理论体系研究基地 |
| 15 | 江苏省老年学研究与培训基地 | 2015 | 江苏省老年学学会 | |
| 16 | 人口老龄化科研基地 | 2014 | 江苏省科协 | 江苏省科协科技思想库基地 |
| 17 | 国家人才理论研究基地（河海大学） | 2014 | 中央人才工作协调小组办公室 | |
| 18 | 国际河流研究中心 | 2013 | 江苏省教育厅 | 江苏高校国际问题研究中心 |
| 19 | 公民道德发展与人的现代化研究基地 | 2013 | 江苏省哲学社会科学规划办公室 | 江苏省哲学社会科学研究基地 |
| 20 | 全国性别\妇女研究与培训基地 | 2013 | 全国妇联、中国妇女研究会 | |
| 21 | 江苏省科技体制改革思想库 | 2012 | 江苏省科技厅 | 江苏省科技思想库 |
| 22 | 中国（南京）人才发展研究中心 | 2012 | 南京市委市政府 | |
| 23 | 江苏企业国际化发展研究基地 | 2011 | 江苏省社科联 | 江苏省决策咨询研究基地 |
| 24 | 江苏沿海资源经济研究中心 | 2011 | 江苏省教育厅 | 江苏高校人文社会科学校外研究基地 |
| 25 | 水利政策法制研究与培训中心 | 2011 | 水利部 | |
| 26 | 水利部人力资源研究院 | 2011 | 水利部 | |
| 27 | 江苏省水资源与可持续发展研究中心 | 2009 | 江苏省教育厅 | 江苏高校哲学社会科学重点研究基地 |
| 28 | 东部资源环境与持续发展研究中心 | 1994 | 江苏省政府、中科院、教育部、水利部、农业部 | |
| 29 | 水利部水库移民经济研究中心 | 1993 | 水利部 | |
| 30 | 水利部水利经济研究所 | 1985 | 水利部 |